مشروع: المعلوماتية الحيوية البنيوية واكتشاف الأدوية – دبلومة جامعة النيل
Structural Bioinformatics and Drug Discovery Course Project at Nu Diploma.
إجراء مراجعة منهجية للأوراق العلمية لتحديد مركبات محتملة تعمل كمثبطات لإنزيم HDAC11.
إعداد ومعالجة الجزيئات المرشحة (Ligands) بصيغة 3D SDF كخطوة تحضيرية لعمليات النمذجة الجزيئية.
تنفيذ تحليل Docking جزيئي بين المركبات المرشحة والبنية المتوقعة لإنزيم HDAC11 باستخدام نموذج AlphaFold.
تحليل وتصور تفاعلات Protein–Ligand لتقييم قوة الارتباط وتحديد أهم الأحماض الأمينية المشاركة في الارتباط باستخدام PyMOL و PLIP.
تفسير نتائج الـDocking لتحديد المركبات الأكثر احتمالًا كمرشحات أولية في Drug Discovery Pipeline